Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF235Q14590 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNF235Q14590 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.8 ms