Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TNFAIP1Q13829 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.7 ms