Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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