Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.3 ms