Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1P54821 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRRX1P54821 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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