Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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PTPRBP23467 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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PTPRBP23467 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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PTPRBP23467 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PTPRBP23467 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PTPRBP23467 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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PTPRBP23467 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
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PTPRBP23467 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRBP23467 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
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