Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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TOP1MTQ969P6 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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TOP1MTQ969P6 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
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TOP1MTQ969P6 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
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TOP1MTQ969P6 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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TOP1MTQ969P6 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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TOP1MTQ969P6 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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