Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KARSQ15046 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KARSQ15046 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KARSQ15046 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
KARSQ15046 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
KARSQ15046 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
KARSQ15046 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
KARSQ15046 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
KARSQ15046 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
KARSQ15046 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KARSQ15046 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KARSQ15046 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KARSQ15046 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KARSQ15046 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KARSQ15046 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
KARSQ15046 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
KARSQ15046 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
KARSQ15046 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
KARSQ15046 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
KARSQ15046 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
KARSQ15046 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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