Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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SNX17Q15036 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SNX17Q15036 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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SNX17Q15036 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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SNX17Q15036 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SNX17Q15036 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SNX17Q15036 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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SNX17Q15036 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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SNX17Q15036 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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