Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CBX3Q13185 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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