Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXD4Q12950 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FOXD4Q12950 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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