Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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