Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme1P97371 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms