Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms