Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP1Q9Y3L3 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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