Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.5 ms