Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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SGCBQ16585 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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SGCBQ16585 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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SGCBQ16585 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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SGCBQ16585 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SGCBQ16585 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
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SGCBQ16585 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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