Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VPS72Q15906 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VPS72Q15906 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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