Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NCOA1Q15788 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NCOA1Q15788 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.3 ms