Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SURF1Q15526 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.1 ms