Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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PDE6HQ13956 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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PDE6HQ13956 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
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PDE6HQ13956 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PDE6HQ13956 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PDE6HQ13956 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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PDE6HQ13956 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PDE6HQ13956 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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PDE6HQ13956 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PDE6HQ13956 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PDE6HQ13956 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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PDE6HQ13956 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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PDE6HQ13956 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PDE6HQ13956 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
PDE6HQ13956 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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