Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
DDX39BQ13838 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX39BQ13838 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
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