Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRAP18433 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197 ms