RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4
BBS9, Protein PTHB1, human
Predictions only
Length
887 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
BBS9
Q3SYG4
MIR520C-201
ENST00000385005
87 nt
BASIC
2.15
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP508-201
ENST00000411327
119 nt
BASIC
2.15
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
ATP6V0E1P3-201
ENST00000420036
246 nt
BASIC
2.15
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU6-922P-201
ENST00000516753
99 nt
BASIC
2.15
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU1-40P-201
ENST00000516816
164 nt
BASIC
2.15
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU1-97P-201
ENST00000516872
164 nt
BASIC
2.15
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR4764-201
ENST00000580680
88 nt
BASIC
2.15
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR4713-201
ENST00000582691
75 nt
BASIC
2.15
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
AL096840.1-201
ENST00000603287
93 nt
BASIC
2.15
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
AC008133.2-201
ENST00000624540
351 nt
BASIC
2.15
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
OR5M1-202
ENST00000641076
4302 nt
APPRIS P1
BASIC
2.14
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MUC15-203
ENST00000455601
3156 nt
APPRIS P1
TSL 2
BASIC
2.14
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1099P-201
ENST00000363533
107 nt
BASIC
2.14
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.360-201
ENST00000365512
102 nt
BASIC
2.14
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU6-49P-201
ENST00000384256
107 nt
BASIC
2.14
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP425-201
ENST00000410336
112 nt
BASIC
2.14
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP338-201
ENST00000410495
85 nt
BASIC
2.14
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU2-40P-201
ENST00000410833
196 nt
BASIC
2.14
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
AC008413.1-201
ENST00000511864
177 nt
BASIC
2.14
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU6-322P-201
ENST00000516010
103 nt
BASIC
2.14
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR1273D-201
ENST00000577266
86 nt
BASIC
2.14
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP138-201
ENST00000365098
114 nt
BASIC
2.13
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
AL451046.2-201
ENST00000403074
277 nt
BASIC
2.13
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.601-201
ENST00000410500
113 nt
BASIC
2.13
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
HMGN1P33-201
ENST00000432945
451 nt
BASIC
2.13
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
AL627230.6-201
ENST00000611129
280 nt
BASIC
2.13
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR8074-201
ENST00000615081
81 nt
BASIC
2.13
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU6-832P-201
ENST00000363319
107 nt
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.354-201
ENST00000365448
111 nt
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR488-201
ENST00000365739
83 nt
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU6-616P-201
ENST00000384353
107 nt
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR577-201
ENST00000385196
96 nt
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
SNORA7.5-201
ENST00000410672
110 nt
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
AC108752.1-201
ENST00000484679
576 nt
TSL 5
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RPL23AP94-201
ENST00000512518
302 nt
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
SNORA77B-201
ENST00000578179
125 nt
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR8063-201
ENST00000621930
81 nt
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
BRCA1-202
ENST00000354071
4497 nt
TSL 1 (best)
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
ZNF355P-201
ENST00000427301
3216 nt
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
SNORA32-201
ENST00000384072
121 nt
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.466-201
ENST00000384294
113 nt
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR653-201
ENST00000385279
96 nt
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MALAT1.1-201
ENST00000618249
95 nt
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
Metazoa_SRP.32-201
ENST00000622685
286 nt
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
PTPRQ-208
ENST00000614701
8289 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR605-201
ENST00000385078
83 nt
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR1270-201
ENST00000459320
83 nt
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
AC005908.1-201
ENST00000468701
347 nt
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU7-41P-201
ENST00000515917
61 nt
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
AC015688.6-201
ENST00000577737
104 nt
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR8055-201
ENST00000610739
97 nt
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
MIR6873-201
ENST00000622788
63 nt
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
Z97988.1-201
ENST00000637697
135 nt
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
OXR1-209
ENST00000517566
4501 nt
TSL 1 (best)
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
FSIP2-206
ENST00000611759
3882 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
KNL1-204
ENST00000527044
5404 nt
TSL 5
BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.377-201
ENST00000365644
108 nt
BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU6-679P-201
ENST00000391003
106 nt
BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
AL162400.2-201
ENST00000427547
157 nt
TSL 3
BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1018P-201
ENST00000516577
106 nt
BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
CYP3A52P-201
ENST00000563326
91 nt
BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
AL442128.1-201
ENST00000615151
90 nt
BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
uc_338.20-201
ENST00000621563
178 nt
BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
BBS9
Q3SYG4
SNORD73B-201
ENST00000364394
72 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.342-201
ENST00000365352
113 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
SNORD41-201
ENST00000386967
70 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
AC245047.7-201
ENST00000440265
293 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
AL353813.1-201
ENST00000440700
253 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
SNORD111.1-201
ENST00000516421
86 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RNU6-521P-201
ENST00000516663
105 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
AC103810.8-201
ENST00000607347
118 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
FAS-AS1.2-201
ENST00000620386
170 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
MIR4251-201
ENST00000635819
61 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
hsa-mir-3158-1.1-201
ENST00000637571
81 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
ASPM-202
ENST00000367408
3747 nt
TSL 1 (best)
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
PYGO1-201
ENST00000302000
8488 nt
TSL 1 (best)
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
SNORD45B-201
ENST00000364617
72 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1201P-201
ENST00000384227
107 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
SNORA18-201
ENST00000384416
132 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
SNORA3.2-201
ENST00000408221
125 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
AC096949.1-201
ENST00000412047
152 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
AC004941.2-201
ENST00000427009
228 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
HMGN2P23-201
ENST00000456759
269 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RNU6-844P-201
ENST00000517175
102 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
MIR8065-201
ENST00000620577
100 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.96-201
ENST00000363092
109 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RNY1P7-201
ENST00000384743
110 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
HMGN2P19-201
ENST00000425149
265 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RPL23AP42-201
ENST00000471152
471 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RNU6-947P-201
ENST00000516264
106 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
MIR548AO-201
ENST00000579992
96 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.783-201
ENST00000613546
102 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1313P-201
ENST00000362622
102 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RNU6-170P-201
ENST00000362832
104 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP48-201
ENST00000363969
126 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
SNORA70B-201
ENST00000384210
135 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RNU6-342P-201
ENST00000384521
104 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
MIR676-201
ENST00000390702
67 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RN7SKP223-201
ENST00000410582
62 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
BBS9
Q3SYG4
RNU6-602P-201
ENST00000411155
105 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
First
Previous
968
Next
Last
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.1 ms