Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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