Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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