Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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DDB1Q16531 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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DDB1Q16531 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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DDB1Q16531 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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DDB1Q16531 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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DDB1Q16531 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DDB1Q16531 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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DDB1Q16531 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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DDB1Q16531 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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DDB1Q16531 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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DDB1Q16531 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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