Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PDE6HQ13956 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279 ms