Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF9Q13886 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KLF9Q13886 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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