Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDE3BQ13370 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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