Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPRAP18433 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRAP18433 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRAP18433 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRAP18433 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRAP18433 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRAP18433 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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PTPRAP18433 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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PTPRAP18433 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRAP18433 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRAP18433 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRAP18433 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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