Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 948 ms