Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFT2D3Q587I9 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SFT2D3Q587I9 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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