Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VAMP3Q15836 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.2 ms