Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A2Q14055 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A2Q14055 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A2Q14055 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A2Q14055 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A2Q14055 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A2Q14055 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A2Q14055 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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COL9A2Q14055 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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COL9A2Q14055 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A2Q14055 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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