Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NPRL3Q12980 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NPRL3Q12980 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms