Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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PTPRBP23467 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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PTPRBP23467 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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PTPRBP23467 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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PTPRBP23467 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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PTPRBP23467 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
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