Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHOC2Q9UQ13 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHOC2Q9UQ13 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
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