Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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SGCBQ16585 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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SGCBQ16585 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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