Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
EIF4EBP1Q13541 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EIF4EBP1Q13541 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.9 ms