Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
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ATRQ13535 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
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ATRQ13535 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
ATRQ13535 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
ATRQ13535 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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ATRQ13535 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
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ATRQ13535 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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