Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPREP23469 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPREP23469 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPREP23469 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPREP23469 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPREP23469 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPREP23469 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPREP23469 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPREP23469 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPREP23469 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPREP23469 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPREP23469 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPREP23469 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPREP23469 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPREP23469 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPREP23469 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPREP23469 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPREP23469 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPREP23469 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPREP23469 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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PTPREP23469 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPREP23469 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPREP23469 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPREP23469 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPREP23469 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPREP23469 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPREP23469 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPREP23469 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPREP23469 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPREP23469 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPREP23469 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPREP23469 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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