Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
DDB1Q16531 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDB1Q16531 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDB1Q16531 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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