Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF9Q13886 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KLF9Q13886 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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