Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CENPEQ02224 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.7 ms