Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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ECM1Q16610 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ECM1Q16610 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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