Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.5 ms