Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RPE65Q16518 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.4 ms