Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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SCN9AQ15858 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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SCN9AQ15858 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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SCN9AQ15858 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN9AQ15858 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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