Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SQSTM1Q13501 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.7 ms