Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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PTPRAP18433 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRAP18433 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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PTPRAP18433 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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